Jornadas sobre "Predicción de enfermedades y caracteres complejos usando información del metagenoma" 

Tipo
Congresos, Jornadas, Seminarios y Talleres.
Estado
Concluido.
Plazas
50
Fecha de inicio
09/09/2019
Fecha de finalización
10/09/2019
Horarios
9-14 y de 15:30 a 18:30 horas

Duración
15 horas
Destinatarios
Estudiantes de Postgrado con interés en estudios metagenómicos

Créditos de libre configuracion
ECTS:0,5
Lugar y aulas de impartición
CRAI-TIC
Tasas de matrícula
Gratuita
Objetivos
El objetivo fundamental es que los participantes se familiaricen con los análisis del metagenoma para la predicción de enfermedades y caracteres complejos en Genética humana y animal.
La necesidad de analizar grandes cantidades de datos para el procesamiento de datos metagenómicos requiere de uso infraestructuras de computación de alto rendimiento como SCAYLE.




Competencias y resultados de aprendizaje
Que los estudiantes conozcan:
.- El uso de la supercomputación en el análisis del metagenoma.
.- El papel del microbioma en la expresión fenotípica de caracteres complejos en animales.
.- La importancia del microbioma en enfermedades humanas 
.-Participación en un Hackathon para análisis de datos metagenómicos en la predicción de caracteres complejos.


Programa

Día 9 septiembre 2019

9.30 Bienvenida y presentación de las jornadas

10.00 Ponencia presentación RES y SCAYLE

10.45 Importancia del microbioma en cáncer. Esther Molina (CNIO).

11.30 pausa

12.00 Importancia del microbioma en caracteres complejos (ganadería). Christian Maltecca (NCSU).

12.45 Ponencia invitada. (Javier Tamamaes, CNB)

13.30 Comida

15.00 Experiencia análisis de datos de microbioma usando recursos RES. (Cristina Esteban y Oscar Gonzalez-Recio)

16.00 Taller uso básico de un supercomputador.

17.30 Introducción al Hackathon

18.00 Cierre día 1

Día 10 septiembre 2019. Hackathon

8.30 Presentación del Hackathon. Objetivos y Reglas.

9.00 Inicio del hackaton

16.00 Presentación de las propuestas y resultados

17.30 Entrega de reconocimientos


Post Hackaton

Se realizará un seguimiento y evaluación más a fondo de las propuestas y métodos desarrollados durante el hackaton, e incluso de valorará la publicación de los resultados.



Criterios de evaluación
Se exigirá la asistencia de al menos el 80% de las sesiones presenciales.
Asistencia a las jornadas y análisis de la participación en el hackathon


Director/es
  • Juan José Arranz Santos. Profesor. Facultad de Veterinaria. Universidad de León.

  • Óscar González Recio. Investigador (OPI) INIA
Profesorado/Ponentes
  • Óscar González Recio. Investigador (OPI) INIA

  • Cristina Esteban Blanco. Fundación Centro de Supercomputación de Castilla y León

  • Jesús Lorenzana Campillo. Fundación Centro Supercomputación
Conferenciante/s
  • Christian Maltecca .. Associate Professor- NCSU

  • Esther Molina Montes. investigadora CNIO

  • Javier Tamames de la Huerta. Investigador CNB
Miembro/s del comité organizador
  • Juan José Arranz Santos. Profesor. Facultad de Veterinaria. Universidad de León.

  • Ruth Alonso Martínez. Responsable Oficina Técnica del Centro de Supercomputación de Castilla y León

  • Óscar González Recio. Investigador (OPI) INIA
Miembro/s del comité científico
  • Juan José Arranz Santos. Profesor. Facultad de Veterinaria. Universidad de León.

  • Óscar González Recio. Investigador (OPI) INIA
Departamento / Centros Implicados
1.- Departamento de Producción Animal (Universidad de León)
2.-Departamento de Mejora Genética Animal (INIA)
3.- SCAYLE



Entidades colaboradoras
  • SCAYLE

  • Red Española de Supercomputación (RES)

  • Universidad de León