1. Introducción a la genómica,
metagenómica y conceptos básicos de resistoma
2. Ejemplos de aplicaciones prácticas de
caracterización de resistoma en datos genómicos en el ámbito clínico,
veterinario o de la cadena alimentaria
3. Ejemplos de aplicaciones prácticas de
caracterización de resistoma en datos metagenómicos en el ámbito clínico,
veterinario o de la cadena alimentaria
4. Ejercicio práctico de análisis de
resistoma en genomas microbianos:
o
Descarga de genomas ensamblados de
repositorios públicos
o
Descarga de metadatos de los genomas
descargados
o
Asignación taxonómica
o
Análisis de elementos genéticos
móviles
o
Tipado microbiano mediante análisis de
genoma completo
o
Detección de genes de resistencia a
los antibióticos y mutaciones que confieran resistencia a antibióticos
o
Localización genómica de los genes de
resistencia (cromosoma, plásmido, integrón u otro tipo de elemento genético
móvil)
5. Ejercicio práctico de análisis de
resistoma en metagenomas:
o
Control de calidad de secuencias para
el análisis de metagenomas
o
Ensamblaje y anotación de metagenomas
o
Análisis de elementos genéticos móviles
en metagenomas
o
Detección de genes de resistencia a
los antibióticos en metagenomas
